


- EP2. 测序圈又杀出一匹黑马?罗氏SBX技术能上桌吃饭吗?
2025年2月20日,罗氏发布了全新测序技术SBX(Sequencing by Expansion),引发业界关注。SBX发布会上宣传的测序准确性达到Q39令人震惊,但这究竟是技术革命还是虚张声势?本期节目中,新主播小泽和小羊将带你深入解析SBX测序技术的核心创新、亮点和潜在局限,探讨其在学界和业界的应用前景。 时间轴: 00:00 – SBX测序技术来了! 小羊和新主播小泽带你聚焦罗氏SBX测序技术! 03:12 – 罗氏的测序执念:一路的收购与尝试 从454测序技术到最新的SBX技术,罗氏十几年在测序领域屡次尝试与挣扎背后的故事。 05:06 – 纳米孔技术 vs. Illumina:测序到底怎么测? 详细解读纳米孔测序与illlumina测序技术的根本区别,以及Roche副总裁“我们高效测序DNA的办法是不测序DNA”的神秘含义。 07:09 – 什么是Xpandomer?罗氏的技术秘密武器 深度剖析SBX的核心Xpandomer技术如何实现信号增强,让测序更清晰、更高效。 08:45 - SBX是纳米孔测序,但是为什么测不长? 作为纳米孔测序的SBX,为什么最终的测序长度止步在一两千? 10:25 – SBX的技术优势在哪里? 从“flexible operation”,到惊人的高通量和高准确度,小泽为你深度解读SBX的多维优势。 21:21 – SBX听起来很厉害,但它有哪些局限? 新技术固然诱人,但价格未知加上技术的潜在局限,让想上桌吃饭的SBX面临挑战。 27:49 – 学术界和工业界,谁更适合SBX? SBX能否真正挑战Illumina的江湖地位?小泽和小羊从各自领域的角度展开探讨。 33:36 – 总结与展望:SBX的未来值得期待吗? SBX带来了短读长测序的新方案,尽管前景光明,但最终影响力还得看价格。 参考资料: * Roche的SBX测序发布的Webinar Recording:https://sequencing.roche.com/us/en/videos/webinar-sequencing-by-expansion-technology.html * X-NTP以及Xpandomer的结构: * 纳米孔读Xpandomer得到的清晰到肉眼可做basecalling的电信号(so crazyyyyyy。。。): * 大家一起来学习一下大佬名言: "Our approach to efficiently sequencing DNA is to not sequence DNA." -- Mark Kokoris, Vice President, Head of SBX Technology at Roche Diagnostics Seattle. 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人,专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学,想要成为生活杂家,攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读,梦想成为生命探险家,过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生,从力学跳槽到生物,身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅,目前专注单细胞测序相关技术开发。
- EP1. 我的姐妹为什么放弃了百万年薪去读博?
八爪鱼bioctopus第一期节目来啦!在这里我们聚焦生物科技、医疗、AI的前沿动态,也分享个人成长的思考与实践。 去年,Alex做了一个让人惊讶的决定:她从美国某药厂R&D部门的生信组辞职,选择回到学术界读博,目前是Berkeley的PhD Student👩🔬。在这期节目里,Alex分享了她的心路历程。 时间轴: 00:00 – 我们是谁? Alex和小羊开场打招呼,从生物科技到AI,从成长故事到行业八卦,咱们啥都聊! 01:15 – 你疯了吧?!辞掉高薪工作去读博? 小羊听说Alex要辞职去读博时,一脸震惊:“你之前的工作不是很不错吗?”Alex讲述自己的纠结——是继续稳定工作,还是追求更深层次的科研? 02:49 – 读博到底是信仰,还是现实考量? Alex回忆自己大学时的“跟风”心理,聊聊当初为什么没有立刻选择读博,而是先工作了几年再回到学术圈。 06:48 – 学界 vs. 业界:科研的意义感从哪里来? 是在学术圈深耕研究、突破未知?还是在业界把技术落地,真正改变患者的生活?Alex和小羊有着不同的答案。 09:14 – 业界到底可以培养人吗? Alex读博的终极目标是成为独立的科研者、影响行业的决策者;那么业界能否给她带来这样的成长呢? 12:10 – 没有 PhD,在业界会被轻视吗? 讨论职场里“学历鄙视链”的现实情况。没有博士学位,真的意味着升职更慢、话语权更少吗? 17:14 – 为什么我没有选择读博?小羊的思考 既然行业里PhD偏多,为什么小羊没走这条路? 21:49 – “小决定睁眼做,大决定闭眼做” 这句研讨会上听来的话,彻底点醒了 Alex,也帮她下定了决心——有些事情,分析再多都没用,去做了才知道值得不值得。 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人,专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学,想要成为生活杂家,攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读,梦想成为生命探险家,过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生,从力学跳槽到生物领域,身体力行成为了无知者无畏的真实写照,目前专注于单细胞测序技术开发。